【2025年】ネットショップ在庫連動システム5選!売上UP&業務効率化のコツ


最近、ネットショップの注文が増えてきて在庫管理が追いつかない。それにミスも増えてきた…。何かいい方法はないかな?

それなら、ネットショップ在庫連動システムを導入するのがおススメです。各ECサイトの在庫を自動で同期できるので、売り越しや欠品のリスクを防ぎながら、業務の負担も大幅に軽減できますよ。
ネットショップの売上が伸びるのは喜ばしいことですが、それに比例して在庫管理の負担も増えてきます。手作業で在庫を管理していると、ミスが発生しやすく、売り越しや欠品によるクレームが増えてしまうことも。実際に、「複数の販路があると在庫管理が煩雑になり、在庫不足や在庫調整ミスが頻発している」というお声を伺ったこともあります。
そこで活躍するのが「ネットショップ在庫連動システム」です!ネットショップと倉庫の在庫を自動で同期し、売り逃しや在庫過多を防ぐことが可能になります。

本記事では、ネットショップ在庫連動システムである「助ネコEC管理システム」を提供している私達が、2025年最新のおすすめネットショップ在庫連動システム5選を厳選。それぞれの特徴や導入メリットを詳しく解説します。
目次(クリックで移動)
ネットショップ在庫連動システムとは?

ネットショップ在庫連動システムとは、複数のECサイトや販売チャネルの在庫情報を自動で同期し、一元管理できるシステムのことを指します。
- 楽天市場
- Amazon
- メルカリShops
- Shopify
- BASE
というような、異なるECモール・カートで商品を販売している場合、それぞれの在庫数を統一し、売り切れや二重販売を防ぐことが可能になります。
従来、ネットショップの在庫管理は手作業で行われることが多く、各販売チャネルの在庫を手動で更新する必要がありました。
しかし、ネットショップ在庫連動システムを導入することで、注文が入るたびに在庫が自動で減算され、各モールや自社サイトに反映されるため、管理ミスを防ぐことができます。
ネットショップ在庫連動システムが必要な理由

ネットショップ運営において、在庫管理のミスは売上や顧客満足度に大きく影響を与えます。特に、以下のような課題を抱えている企業の場合、ネットショップ在庫連動システムの導入が不可欠です。
- 複数モールでの在庫管理が手間になっている
- セールやキャンペーン時に在庫管理が追いつかない
- 在庫過多や売れ残りのリスクがある
- 誤出荷や発送遅延が発生しやすい
複数モールでの在庫管理が手間になっている
ネットショップを運営する企業の多くは、楽天市場、Amazon、メルカリShops、Shopify、BASEなど、複数のECモールやカートを活用して売上を最大化しようとしています。
しかし、それぞれの販売チャネルごとに在庫を管理するのは、手間がかかるだけでなく、管理ミスが発生しやすいという課題があります。
手動での在庫管理の問題点は、
- 受注が発生するたびに、各モールごとに在庫を手作業で更新する必要がある
- 更新のタイミングがずれると、売り越し(在庫切れによる注文キャンセル)が発生
- 逆に、あるモールで在庫数を減らしすぎてしまうと、販売機会を逃してしまう
- 複数モールで管理しているうちに、在庫数がどれが正しいのか分からなくなる
こうした課題を解決するには、ネットショップ在庫連動システムを導入し、各モールの在庫を自動で連携することが不可欠です。
注文が入ったら在庫データが自動で更新されるため、手作業でのミスがなくなり、業務の負担が大幅に軽減されます。
セールやキャンペーン時に在庫管理が追いつかない
楽天スーパーセールやAmazonのプライムデー、超メルカリ市など、ECモールでは定期的に大規模なセールやキャンペーンが開催されます。
こうしたセール期間中は通常よりも注文数が急増するため、在庫管理の対応が遅れると売上機会の損失につながる可能性があります。
セール時の在庫管理の課題は、
- 注文が急増し、在庫更新が間に合わない
→ セール開始直後に大量の注文が入り、手作業で在庫を調整するのが困難になる。 - 売り越しや欠品が発生しやすい
→ 在庫が残っていると誤認して販売した結果、在庫切れによる注文キャンセルが発生し、顧客の不満につながる。 - 出荷作業が追いつかず、発送遅延が発生
→ 在庫ズレが発生すると、どの商品がどのくらい必要なのか混乱し、倉庫作業の遅れにつながる。
解決策としては、ネットショップ在庫連動システムを導入することで、セール期間中の在庫ズレを最小限に抑え、スムーズな販売が可能になります。
在庫過多や売れ残りのリスクがある
ネットショップ運営では、売り越し(在庫切れ)を防ぐために、多めに在庫を確保する企業も少なくありません。
しかし、過剰に在庫を持ちすぎると、保管コストが増大し、キャッシュフローを圧迫するリスクがあります。
在庫過多の主な原因は、
- 需要予測のミス
→ 予測以上に商品が売れず、大量の在庫が残ってしまう。 - セール時に大量発注しすぎた
→ セール後に需要が急減し、売れ残りのリスクが高まる。 - 販売チャネルごとに異なる在庫数を設定している
→ あるモールでは在庫切れだが、別のモールには大量に残っているケースが発生する。
などなど、ネットショップ在庫連動システムで適切な在庫管理を行うことで、過剰な仕入れによるコスト増を抑え、在庫を効率的に回転させることが可能になります。
誤出荷や発送遅延が発生しやすい
ネットショップでは、注文が確定した後の物流プロセスも非常に重要です。しかし、在庫管理が適切に行われていないと、誤出荷や発送遅延が発生しやすくなります。
誤出荷・発送遅延が発生する主な原因は、
- 在庫数のズレがある
→ システム上の在庫と実際の在庫数が異なり、注文された商品が見つからないケースが発生する。 - 受注データの反映が遅れる
→ 複数モールで販売していると、手動で注文データを処理する必要があり、更新が遅れることで出荷ミスが増える。 - 倉庫作業の負担が増え、ピッキングミスが発生
→ 注文件数が増えると、倉庫スタッフの作業負担も増加し、誤った商品を出荷してしまうリスクが高まる。
ネットショップ在庫連動システムを使うことで、誤出荷や発送遅延のリスクを最小限に抑え、顧客満足度の向上につなげることができます。
ネットショップ在庫連動システムの仕組み

ネットショップ在庫連動システムは、主に
- 受注情報
- 在庫情報
- 発注・補充
この3つの機能を自動化することで、効率的な在庫管理を実現します。
1. 受注情報の自動連携
各販売チャネルで注文が入ると、ネットショップ在庫連動システムが受注情報を取得し、在庫データを更新します。例えば、楽天市場で商品が1つ売れた場合、システムが情報を取得し、AmazonやメルカリShopsへ1つ減算した在庫数をアップロードします。
「助ネコEC管理システム」の対応モール・カート一覧はこちら>>
2. 在庫情報の更新
在庫データはすべての販売チャネルで同期されるため、売り越しや二重販売のリスクを回避できます。特に、セール時や短期間での大量注文が発生した際に、在庫ズレを防ぐための重要な役割を果たします。
3. 発注・補充の最適化
システムによっては、一定の在庫数を下回ると自動で発注をかける機能が備わっているものもあります。また、AIを活用して過去の販売データを分析し、適切な発注タイミングを提案する機能を持つものもあります。
自動発注機能が備わった「発注管理」システムについての詳細はこちら>>
ネットショップ在庫連動システムと倉庫管理システム(WMS)の違い

在庫管理を効率化するツールには、ネットショップ在庫連動システムのほかに倉庫管理システム(WMS)があります。両者は似ていますが、役割が異なります。
項目 | ネットショップ在庫連動システム | 倉庫管理システム(WMS) |
---|---|---|
目的 | ECモール・販売チャネルの在庫を同期 | 倉庫内の在庫の保管・出荷を管理 |
対象 | 楽天市場、Amazon、メルカリShopsなどのネットショップ | 物流倉庫や店舗の在庫管理 |
主な機能 | 受注・在庫の自動更新、多モール連携、在庫アラート | ピッキング、梱包、出荷管理、入庫管理 |
導入のメリット | 売り越し防止、業務効率化、販売機会の最大化 | 出荷ミス削減、倉庫業務の最適化 |
ネットショップ在庫連動システムは「ネットショップの在庫管理」に特化しており、複数モールの在庫を一元管理するためのツールです。
一方、倉庫管理システム(WMS)は倉庫の内部管理や出荷処理の最適化を目的としており、両者を組み合わせて活用すると、より効率的な在庫管理が可能になります。
おすすめのネットショップ在庫連動システム5選
ここからは、おすすめのネットショップ在庫連動システム5選を紹介します。それぞれの特徴や料金プランを比較し、自社に最適なシステムを選定する際の参考にしてください。
1. 助ネコEC管理システム

特徴
- 複数店舗の在庫連動:楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピングなど、複数のネットショップ間で在庫数を自動連携します。各店舗の商品コードが異なっていても、助ネコ上で紐づけることで連動が可能です。
- セット商品対応:セット商品の在庫管理も可能で、セットを構成する各商品の在庫数を自動で調整します。
- 在庫お知らせ機能:設定した発注点に達した際に、管理画面上やメールで通知し、適切な発注タイミングをサポートします。
料金プラン
- 月額料金:21,000円(連携サイト数&取込件数&商品点数の上限なしで完全固定!)
おすすめポイント
助ネコは、直感的な操作性と充実したサポート体制が特徴で、初めてネットショップ在庫連動システムを導入する企業にも適しています。また、商品点数によらない固定料金制のため、コスト管理がしやすい点も魅力です。実際に導入されたEC事業者様からは、「導入以前は在庫調整ミスが多く、その修正に多くの時間を割いていましたが、助ネコでは在庫データが自動で更新されるため、ミスが大幅に減りました。」というお声をいただいています。
2. ネクストエンジン

特徴
- 多機能な一元管理:受注管理、在庫管理、商品登録など、EC運営に必要な機能を200以上搭載しています。
- 豊富な連携先:主要なECモールやカートとの連携が可能で、多店舗展開を強力にサポートします。
- カスタマイズ性:運用方針に合わせて、柔軟なカスタマイズが可能です。
料金プラン
- 月額料金:3,000円~
3. CROSS MALL(クロスモール)

特徴
- 楽天市場、Amazon、Yahoo!ショッピング、自社ECなど、複数の販売チャネルを一括管理できます。
- 各店舗の在庫数を自動で同期し、売り越しや在庫ダブりを防ぎます。
- 在庫だけでなく、仕入れや発注管理機能も搭載しており、仕入れの最適化が可能です。
料金プラン
- 月額料金:10,000円~
4. TEMPOSTAR(テンポスター)

特徴
- ネットショップだけでなく、実店舗や倉庫と連携し、全ての販売チャネルの在庫を一元管理できます。
- 受注処理や出荷指示を自動化することで、業務の効率化を実現
- 他のシステムとのAPI連携により、自社の運営スタイルに合わせたカスタマイズが可能。
料金プラン
- 月額料金:11,000円~
5. Zaiko Robot

特徴
- 在庫情報を更新し、在庫の過不足を防ぎます。
- 楽天市場、Yahoo!ショッピング、Amazon、au PAY マーケットなど、多くのECモールと連携可能。
- 売上データを分析し、適正在庫を維持するための予測機能を搭載。
料金プラン
- 月額料金:30,000円~
ネットショップ在庫連動システムを活用して売上を伸ばす方法

1. データ分析を活用して適正在庫を維持
売上データや在庫回転率を分析し、適正在庫を維持することで、売り逃しを防ぎ、在庫コストを最適化できます。
2. セール・キャンペーン時の在庫管理を強化
楽天スーパーセールやAmazonのプライムデーなど、大型イベントの際に売上が急増すると、在庫管理のミスが発生しやすくなります。事前に適切な在庫を確保し、販売機会を最大化しましょう。
3. 倉庫管理システム(WMS)との連携
ネットショップ在庫連動システムと倉庫管理システムを連携させることで、誤出荷を防ぎ、出荷スピードを向上させることができます。
4. 販売チャネルを増やして売上を最大化
ネットショップ在庫連動システムを導入することで、複数のECモールや自社サイトの在庫を一元管理できるため、新たな販売チャネルを拡大しやすくなります。
「助ネコEC管理システム」の対応モール・カート一覧はこちら>>
まとめ:ネットショップ在庫連動システムで売上アップを目指そう!

ネットショップ在庫連動システムは、複数の販売チャネルの在庫情報をリアルタイムで同期し、業務の効率化と売上向上を実現するための重要なツールです。
在庫のリアルタイム更新や発注・補充の自動化により、売り越しや二重販売のリスクを防ぎ、スムーズなネットショップ運営をサポートします。
本記事で紹介した2025年最新のネットショップ在庫連動システム5選を参考に、自社に合ったツールを導入し、売上アップを目指しましょう!